Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sdc4O35988 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sdc4O35988 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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