Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sp100O35892 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Sp100O35892 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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