Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stag2O35638 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms