Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scarb2O35114 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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