Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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