Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp35M0QWN7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp35M0QWN7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms