Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccer2J3QPU5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms