Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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