Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm3415J3QMS8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3415J3QMS8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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