Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930544D05RikJ3QK56 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms