Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms