Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ScaperF8VQ70 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms