Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Farp1F8VPU2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms