Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zfp988F6VKC7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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