Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms