Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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BC067074F6RXI4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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BC067074F6RXI4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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BC067074F6RXI4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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BC067074F6RXI4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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BC067074F6RXI4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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BC067074F6RXI4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC067074F6RXI4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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