Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CenpfE9Q3P4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms