Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E430018J23RikE9PZQ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms