Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ddx60E9PZQ1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms