Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Sfta2E9PXB6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Sfta2E9PXB6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms