Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms