Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defa28D3Z1V9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms