Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3259D3YUK0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm3259D3YUK0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm3259D3YUK0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3259D3YUK0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3259D3YUK0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm3259D3YUK0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3259D3YUK0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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