Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx8D3YU81 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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