Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cyp26c1B2RXA7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyp26c1B2RXA7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms