Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap58B2RW38 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms