Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atp8b5A3FIN4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b5A3FIN4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Atp8b5A3FIN4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms