Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms