Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmpd1A2AKB4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmpd1A2AKB4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms