Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cyb561d1A2AE42 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms