Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms