Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vstm4T1NXB5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms