Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Crlf3Q9Z2L7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf3Q9Z2L7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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