Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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