Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl27Q9Z1X0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms