Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3b1Q9Z1T1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms