Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx1Q9WV80 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms