Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms