Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry2Q9R194 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry2Q9R194 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms