Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms