Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fhl3Q9R059 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms