Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas3Q9QZQ0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas3Q9QZQ0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas3Q9QZQ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas3Q9QZQ0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Npas3Q9QZQ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Npas3Q9QZQ0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Npas3Q9QZQ0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas3Q9QZQ0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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