Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tomm40Q9QYA2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms