Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx4Q9QY61 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms