Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkp3Q9QY23 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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