Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Opn4Q9QXZ9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms