Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms