Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ChmQ9QXG2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChmQ9QXG2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms