Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sall2Q9QX96 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms