Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1aQ9JLR9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1aQ9JLR9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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